Родился в 1924 году в деревне Руковец Кировского района Могилевской области. Белорус, из крестьян.

Юношеские годы Владимира Афанасьевича опалены войной. С 1942 по 1943 годы он участник партизанского движения на Беларуси. В 1943-1944 годах – солдат Красной Армии. Его боевой путь отмечен орденами Красной Звезды и Отечественной войны 1-й степени и медалями «Партизану Отечественной войны» и «За победу над Германией».

После Великой Отечественной войны В.А. Гончаров окончил в 1949 году Гомельский государственный педагогический институт им. В.П.Чкалова, в 1953 – аспирантуру Белорусского политехнического института и до 1956 года работает научным сотрудником института истории партии при ЦК КПБ.

С 1956 года кандидат исторических наук В.А. Гончаров работал ассистентом кафедры основ марксизма-ленинизма Гомельского государственного педагогического института им. В.П. Чкалова, а с 1959 года – в Гродненском государственном педагогическом институте.