Родился в 1917 году в селе Клишки Шосткинского района Сумской области. Украинец, из крестьян.

После окончания в 1930 году семи классов Василий Павлович помогал родителям по хозяйству, в 1934–1935 годах работал делопроизводителем в сельском совете, в 1935–1938 годах работал на стройке и учился на рабфаке в городе Шостка. В 1938 году В.П. Рубаник постапил в Киевский государственный университет, но закончить его помешало нападение на СССР фашистской Германии. Добровольцем студент 3-го курса В.П. Рубаник ушёл на фронт, на защиту своей Родины.

Василий Павлович участвовал в боевых действиях в составе Калининского, Воронежского, 1-го и 4-го Украинских фронтов. Его боевой путь отмечен многими наградами, но самими дорогими для него были ордена Великой Отечественной войны 1-й и 2-й степени.

Уволившись из армии в запас в 1946 году, В.П. Рубаник до 1950 года работал учителем физики и математики в школах города Шостки, заочно окончил в 1948 году Киевский педагогический институт. В 1950 году он поступил в аспирантуру Киевского государственного университета, которую окончил в 1953 году с защитой кандидатской диссертации.

С 1953 года трудовая и научная деятельность Василия Павловича связана с Черновицким государственным университетом, где он работал старшим преподавателем, доцентом, и.о. заведующего кафедрой дифференциальных уравнений, заведующим кафедрой прикладной математики и механики, деканом математического факультета, проректором по науке.

В 1976 году В.П. Рубаник переехал в город Гомель. Работая в Гомельском государственном университет, Василий Павлович внёс большой вклад в развитие математического факультета. В разное время он возглавлял кафедры математических проблем управления, вычислительной математики и программирования, работал профессором. В декабре 1989 года по состоянию здоровья Василий Павлович ушел на пенсию.